关于黄蜡石的形成原因，近年来各地多有研究。
浙江省地质矿产研究所、浙江省珠宝玉石首饰鉴定中心，对省内黄蜡石资源进行野外实地调查，并对其宝石学、矿物学特征进行了系统研究，认为产出黄蜡石的古老的地层是震旦系上部皮园村组化学成因的硅质岩，经成岩、变质及风化磨蚀而形成。中生代火山岩中产出的
大量硅质岩脉也提供了丰富的成矿“原料”。
黄蜡石的原岩均为硅质岩，各种原岩受到构造变动、火山活动、热液作用等影响，产生复杂的物理和化学变化，包括重结晶、热变质等，导致矿物成分及结构构造的变化，后受构造变动的影响，岩石露出地表，与地表酸性土壤环境长期接触，或在溪流中长期磨蚀，经历染色、磨圆，形成河谷中的籽料。