许多研究表明，种植物的质量安全与产地的土壤环境关系密切。重金属一般先进入土壤并积累，种植物通过根系从土壤中吸收，富集重金属，有时也通过叶片上的气孔从空气中吸收气态或尘态的重金属元素。
近几年，种植地因农药、肥料、生长素的大量施用及工业“三废”的污染，土壤重金属含量超标较严重且普遍，这不仅毒害土壤-植物系统，降低种植物品质，还会通过径流和淋洗作用污染地表水，尤其重要的是通过食物链的方式进入人体内，对于重金属的富集人体难以代谢，直接或间接危害人体器官的健康。
重金属污染的类型比较多样，能够给土壤造成污染的重金属也有很多种，其中包括 Hg、Cr、Pb 等 具有一定生物毒性的重金属，还有Zn 这样毒性比较 小的金属元素。这些具有显著生物毒性的金属一旦进 入土壤当中，就会被土壤中的胶体吸附，之后重金属会与土壤中的无机物、有机物等产生反应，生成一种 全新的混合物。这种混合物不会再与土壤中其他有机物、无机物发生反应，它不会被土壤中的微生物 分解，该混合物变为一种不能降解的物质存在于土壤当中，经过时间的推移，这种混合物的量越聚越多， 导致土壤的变化。这些混合物不会被土壤中的微生物降解，可以被植物吸收，人类或者动 物食用植物，使这些混合物进入体内，影响人们 的身体健康。
土壤检测项目：
水分、pH、全氮、全磷、全钾、水解氮、有效磷、速效钾、铵态氮、氨氮、硝态氮、硝酸盐氮、亚硝酸盐氮、全盐量、水溶性盐总量、钾离子、钙离子、钠离子、镁离子、氯离子、硫酸根、碳酸氢根、碳酸根、水溶性和酸溶性硫酸盐、阳离子交换量、交换性钙、交换性镁、交换性钾、交换性钠、交换性盐基总量、盐基饱和度、有机质、有机碳、颗粒组成（机械组成）、微团聚体组成、容重、烧失量、碳酸钙钠、钾、铅、镉、汞、砷、铜、锌、镍、铬、硒、硅、六价铬、氡、铁、锰、钙、镁、铝、钡、钴、银、钼、锑、钒、硼、锰、铁、铜、有效硫、有效硅、有效硼、有效态锌、石油类(矿物油)、硫化物、挥发酚、氰化物、氟化物、六六六、滴滴涕、苯并（a）芘、挥发性有机物、半挥发性有机物、多氯联苯、艾氏剂、狄氏剂、异狄氏剂、环氧七氯、七氯、有机磷农药（速灭磷，甲拌磷，二嗪磷，异稻瘟净，甲基对硫磷 、杀螟硫磷，溴硫磷 ，稻丰散，杀扑磷）。
土壤生物学指标：
菌落总数、大肠菌群、大肠杆菌、霉菌、酵母菌等各类常规微生物；
肠杆菌科、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、肠杆菌属等；
非常规微生物：
微生物量碳、微生物量氮、生物多样性等；
脲酶、过氧化氢酶、磷酸酶、蔗糖酶、纤维素酶、蛋白酶等；
有机质、胡敏酸、富里酸、腐殖质；
土壤污染物指标：各类农药残留检测、各类抗生素检测；
土壤营养指标：有机质、全氮、速效钾、速效磷、速效氮、酸碱度、碳氮比、阳离子交换量；
土壤代谢组学分析：土壤中各类代谢物分析。
